Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms