Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms