Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
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