Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms