Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHAF1AQ13111 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHAF1AQ13111 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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