Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms