Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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