Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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