Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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LRRTM2O43300 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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