Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SALL4Q9UJQ4 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SALL4Q9UJQ4 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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