Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms