Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms