Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CTXN3Q4LDR2 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms