Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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