Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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ALCAMQ13740 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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