Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ATP1A4Q13733 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ATP1A4Q13733 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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