Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms