Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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