Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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