Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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