Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms