Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms