Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms