Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms