Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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