Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS2Q9NRF8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms