Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD3Q9H7E2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms