Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NYXQ9GZU5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms