Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d2Q8VD57 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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