Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT27Q7Z3Y8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms