Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms