Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HECW1Q76N89 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HECW1Q76N89 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HECW1Q76N89 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms