Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms