Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX8Q68G74 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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