Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms