Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms