Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms