Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D130052B06RikQ3UW13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms