Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsg1Q3UM18 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms