Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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