Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR3Q13615 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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