Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD2Q13200 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms