Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClgnP52194 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms