Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP6P35125 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP6P35125 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP6P35125 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP6P35125 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP6P35125 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP6P35125 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP6P35125 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP6P35125 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP6P35125 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP6P35125 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP6P35125 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP6P35125 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms