Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL3RAP26951 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms