Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms