Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms