Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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USP18Q9UMW8 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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