Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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