Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms